L’outil PAOHVis est développé depuis 2018 au sein de l’équipe Aviz ; il permet l’exploration visuelle interactive d’hypergraphes dynamiques en s’appuyant sur le principe de biofabric proposé en 2012 par Longabaugh. Pour mémoire, un hypergraphe est un graphe où un lien – un hyperlien – peut contenir de 1 à n sommets. Comme de nombreux outils développés par Fekete et ses collaborateurs et collaboratrices, l’outil offre des perspectives intéressantes, d’autant plus que l’outil est disponible en ligne et s’avère à l’usage relativement aisé à utiliser. Ce qui suit présente les principales fonctionnalités, le format de données, l’intérêt et les limites actuelles de l’outil. Pour plus de détails, voir la page du projet.
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Initiation a l’analyse de réseaux – nice 2019 – supports
La deuxième édition de l’école Initiation à l’analyse de réseaux en SHS est désormais terminée. Les liens ci-dessous permettent de récupérer l’ensemble des supports utilisés (cours, ateliers, bibliographie). Un grand merci à l’ensemble des intervenant.e.s et participant.e.s, au personnel du CROUS et du campus Carlone. Un très grand-merci à Pierre-Yves Beaurepaire et un immense merci à Silvia Marzagalli.
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Sur la détection de communautés en général et avec R en particulier
C’est devenu un rituel : j’assiste à une présentation d’analyste de réseaux, la personne présente un graphe touffu (pléonasme) avec plein de couleurs (et souvent des liens courbes) et explique que les couleurs représentent “les communautés détectées dans le graphe”. La présentation terminée, je lève la main et, si on me donne la parole, je signale que “les communautés dans le graphe”, ça ne veut rien dire… Petit point d’explication ci-dessous. Il s’agit d’un billet d’humeur individuel qui ne saurait représenter “le point de vue officiel du gdr sur le sujet ” (le gdr n’a de toute façon pas de point de vue officiel).
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Initiation à l’analyse de réseaux (Rennes, 15-16 octobre 2019)
Update : la date limite de candidature est repoussée au 30 juin 2019. Il y a des places, profitez-en… CV + LM (en français merci, et deux pages max) à envoyer à gdr.arshs@gmail.com.
Le groupement de recherche Analyse de réseaux en SHS, en collaboration avec le groupe Réseaux et Histoire, propose deux journées d’initiation à l’analyse de réseaux à Rennes les 15 et 16 octobre 2019. Cette formation gratuite sera suivie des cinquièmes rencontres Réseaux et Histoire. Tous les détails ci-dessous.
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École organisée par le groupement de recherche Analyse de réseaux en SHS avec le soutien du Centre de la Méditerranée Moderne et Contemporaine.
Public
Cette école s’adresse à toute personne engagée dans une démarche de recherche et souhaitant être formée à l’analyse de réseaux, quelle que soit sa discipline et son statut (étudiant.e, doctorant.e, ingénieur.e, chercheur.se ou enseignant.e-chercheur.se). Continuer la lecture de Initiation à l’analyse de réseaux en shs, Nice (1-6 juillet 2019)
Le logiciel Visone à l’essai
Ce qui suit n’engage évidemment que son auteur et non l’ensemble des membres du groupement de recherche…
Lorsqu’on fait régulièrement de l’analyse de réseaux, il est rare qu’on utilise un logiciel presse-boutons. On fait du R, du Python, on code en C, que sais-je encore. Lorsqu’on fait des formations d’initiation à l’analyse de réseaux à des étudiant.e.s de SHS, il est commode d’avoir un logiciel à interface graphique correct sous la main. Correct signifie a minima multi-plateforme et gratuit – ce qui disqualifie Ucinet (Windows et payant), Pajek (Windows) ou NodeXL (module pour Excel 2007 et plus). J’avais testé – sans être convaincu – Visone en 2012, petit tour d’horizon de la version 2.17 sortie en février 2017.
Continuer la lecture de Le logiciel Visone à l’essaiÉcole thématique Réseaux et complexité (Cargèse, 2018)
Vous trouverez ici le programme détaillé et, en format pdf, les diaporamas des conférences et les supports des ateliers de l’école thématique Réseaux et complexité (Cargèse, 24 au 28 septembre 2018). Vous pouvez également consulter le blog de notre ami Olivier Charbonneau pour des notes prises sur le vif.
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Analyse des réseaux et applications : approche interdisciplinaire (Marseille, 2018-2019)
Nos collègues Claire Bidart et Pierre Livet poursuivent leur passionnant séminaire doctoral interdisciplinaire cette année encore. Le programme est disponible ci-dessous et en téléchargement en .pdf.
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Cytoscape et R : nouvelles ressources en ligne
A la toute récente école thématique Réseaux et complexité (Cargèse, 24-28 septembre 2018), deux ateliers ont permis aux participant.e.s de se former à différents logiciels. Guillaume Brysbaert et Sébastien Plutniak ont saisi l’opportunité pour rédiger des tutoriaux complets et accessibles consacrés respectivement à Cytoscape et à R, tutoriaux que vous pouvez télécharger ci-dessous.
Guillaume Brysbaert : Initiation à Cytoscape (Lille, décembre 2017 et Cargèse, septembre 2018)
Sébastien Plutniak : Analyse de graphe avec R
Les deux tutoriaux rédigés pour Cargèse s’appuient sur le même jeu de données, le fameux Zachary karate club téléchargeable ici.
En direct de l’école thématique de Cargèse
Le GDR organise actuellement en Corse une école thématique sur le thème “Analyse de réseaux et complexité”. Vous retrouverez dans les prochaines semaines sur ce carnet des liens vers les supports de formation. En attendant, vous pouvez suivre en direct les notes du dynamique participant Olivier Charbonneau.
Les liens vers les notes des jours suivant sont dans les “pings” ci-dessous ! (Merci Olivier)
École thématique Analyse de réseaux et complexité, Cargèse (Corse), 24-28 septembre 2018
Mise à jour d’octobre : programme détaillé et diaporamas des conférences sont disponibles sur ce carnet à l’adresse https://arshs.hypotheses.org/699.
L’objectif de l’école thématique est de participer à la formation de chercheur.se.s, doctorant.e.s et ingénieur.e.s de disciplines variées souhaitant se former à l’analyse de réseaux, domaine de recherche en pleine évolution. (télécharger la version .pdf)
Cette école est pluridisciplinaire, avec un centrage sur les sciences sociales (sociologie, géographie, histoire…) et une ouverture spécifique sur d’autres disciplines (informatique, statistique, géomatique…), dans le but de favoriser échanges et discussions entre les disciplines abordant cette thématique de recherche.
Analyse de réseaux en archéologie, géographie et histoire, Rennes – 3 octobre 2017
Nos collègues rennaises Karine Karila-Cohen et Isabelle Rosé organisent une journée d’études intitulée L’analyse de réseaux en Archéologie , géographie et Histoire : quelles entités pour quelles enquêtes ? le 3 octobre à Rennes. Si les étudiant.e.s de M2 sont prioritaires, il est néanmoins possible d’assister à la journée.
Programme
Salle S 203
10h45-12h30 : Introduction à l’analyse de réseaux (Karine KARILA-COHEN)
Amphi E3
14h-15h : Réseaux et histoire (Karine KARILA-COHEN & Isabelle ROSÉ)
15h-16h : Réseaux et géographie (Laurent BEAUGUITTE)
16h15-17h15 : Réseaux et archéologie (Magali WATTEAUX)
École initiation à l’analyse de réseaux, été 2017, supports de cours
Ce billet permet de récupérer l’ensemble des supports des différent.e.s intervenant.e.s de l’école d’été organisée par le GDR Analyse de réseaux en SHS et le groupe Res-Hist (Réseaux et histoire) à Nice du 3 au 8 juillet 2017.
Bibliographies conseillés par les intervenant.e.s
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Initiation à l’analyse de réseaux – 3 au 8 juillet 2017, Nice
Ce billet, qui sera complété et enrichi dans les semaines à venir, donne le programme détaillé de l’école d’été organisé par le GDR Analyse de réseaux en SHS et le groupe Res-Hist (Réseaux et histoire) et des pistes bibliographiques.
Les cours et ateliers ont lieu en salle informatique. Il est cependant recommandé d’apporter un ordinateur portable sur lequel vous avez téléchargé et installé les logiciels suivants : R, RStudio, Cytoscape et un éditeur de texte correct (NotePad++ pour Windows, Geany pour Linux, etc.). Des codes personnels vous permettront de vous connecter à internet pour l’installation des packages R utiles (igraph, statnet, bipartite, tm).
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Katherine Ognyanova, Visualisation dynamique de réseaux avec R
Le tutoriel de Katya Ognyanova consacré à la visualisation de réseaux avec R, disponible en ligne à cette adresse, est le meilleur que je connaisse. Il m’est donc paru utile de le traduire. Une première partie concernait les visualisations statiques.
Cette seconde partie (pdf, 4 Mo) est consacrée aux visualisations dynamiques et interactives.
Les jeux de données et le script sont téléchargeables ici.