Archives par mot-clé : Cytoscape

Cytoscape et R : nouvelles ressources en ligne

A la toute récente école thématique Réseaux et complexité (Cargèse, 24-28 septembre 2018), deux ateliers ont permis aux participant.e.s de se former à différents logiciels. Guillaume Brysbaert  et Sébastien Plutniak ont saisi l’opportunité pour rédiger des tutoriaux complets et accessibles consacrés respectivement à Cytoscape et à R, tutoriaux que vous pouvez télécharger ci-dessous.

Guillaume Brysbaert : Initiation à Cytoscape (Lille, décembre 2017 et Cargèse, septembre 2018)

Sébastien Plutniak : Analyse de graphe avec R

Les deux tutoriaux rédigés pour Cargèse s’appuient sur le même jeu de données, le fameux Zachary karate club téléchargeable ici.

Débuter avec Cytoscape 3.4.0

Bonjour, nous sommes deux étudiants en dernière année d’école d’ingénieur. Dans ce billet nous allons présenter le logiciel d’analyse de réseau gratuit Cytoscape, ses fonctionnalités et comment le prendre rapidement en main.

Qu’est ce que c’est:
Cytoscape est un logiciel open source qui permet l’analyse de réseaux complexes et leurs visualisations. Il est basé sur une API (interface de programmation) en Java.

Pour quels systèmes d’exploitation ?
Pour les plateformes Linux, Windows et Mac OS X.

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